以木木豆为首的四位小侦探顺着父亲留下的笔记，前往各个星球搜寻神秘组织的蛛丝马迹，沿途成功破获各种离奇案件，最后协助宇宙安全局成功捣毁神秘组织，解除宇宙危机。

在宇宙星际空间，一日，木木豆的父亲木森突然失踪了，留下一封信，让木木星好好管理四人侦探事务所，于是木木星开始了重振事务所的故事。期间，在侦破案件中，结识了知识丰富的糖豆，神秘失忆女阿布豆以及胆小打杂的卤豆，四人一起发挥聪明才智，在宇宙各个星球中，破获许多震惊全宇宙的大案，并且帮助了许多宇宙居民。到底是一段怎么样的侦探旅程呢？